Một vương quốc được tạo ra thông qua âm nhạc phải đối mặt với một tương lai bất định sau khi một con quái vật tên là "Tổ tiên" tàn phá vùng đất bằng "Cơn mưa rỗng" hủy diệt. Cơn mưa nguy hiểm này khiến bất kỳ ai chạm vào đều 'nở hoa', biến thành một loạt cánh hoa trắng và cuối cùng biến mất khỏi sự tồn tại. DEEMO II theo chân Echo, một cô gái đã nở hoa nhưng lại xuất hiện một cách bí ẩn và Deemo, một Người bảo vệ nhà ga bí ẩn, khi họ hành trình qua thế giới ngập trong mưa này với hy vọng tìm được cách cứu nó.