Un regno creato attraverso la musica affronta un futuro incerto dopo che un mostro chiamato "The Ancestor" affligge la terra con una distruttiva "Hollow Rain". Questa pioggia pericolosa fa "sbocciare" chiunque la tocchi, trasformandosi in un turbinio di petali di fiori bianchi e alla fine svanendo dall'esistenza. DEEMO II segue Echo, una ragazza che è sbocciata ma che è misteriosamente riapparsa, e Deemo, un enigmatico guardiano della stazione, mentre viaggiano attraverso questo mondo bagnato dalla pioggia nella speranza di trovare un modo per salvarlo.